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设计单位一般都对工程项目设计实行专业部室和项目组相结合的矩阵管理方式，设计各专业部室和项目组对设计质量都负有管理和控制的职责。在项目实施过程中，无论是项目组集中办公还是不集中办公，设计各部室和项目组的职责不变。由设计各专业部室派往项目组的专业负责人和设计人员，在质量控制上受设计各部室和项目组的双重领导。
设计各部室的质量职责主要是：
（1）为项目派遣符合资格要求的专业负责人和各级设计人员，保证项目具有足够质量和数量的人力资源，以确保设计质量。
（2）负责指导和监督参加项目组工作的专业人员在生产活动中执行公司的质量体系文件，并采取措施对各专业的设计过程实施有效的控制。
（3）负责工程项目中各专业标准、规范的采用，并确保使用现行有效版本。
（4）负责确定设计中采用的专业技术方案，对设计专业技术方案的先进性、可靠性、合理性负责，确保专业技术方案的质量。
（5）必要时参加项目的合同评审和承包方的资格审查。
（6）组织或参加设计各阶段设计输入、设计输出、设计成品的评审或验证。
（7）负责设备、材料供货厂商报价的技术评审。
（8）在实施项目变更或用户变更过程中，严格执行设计更改程序。
（9）设计过程中出现设计不合格品时，严格执行不合格品的控制程序。
（10）设计各专业负责人和各级设计人员，严格执行作业指导书，例如：专业职责范围及设计各阶段的任务、本专业与其他专业的关系、专业工作程序、专业质量保证（验证）程序等，以确保专业设计的质量。
（11）负责收集、编目和管理设计过程中产生的各种质量记录，如室级设计评审记录、设计验证记录、校审记录等。